Зоологический музей университета был создан при кафедре зоологии по инициативе ее первого заведующего – Шкорбатова Георгия Леонидовича. Первые экскурсии в музее были проведены в конце 1976 г. Научное руководство первые 20 лет существования музея осуществлялось доц. кафедры – Хелевиной С.А. Текущую работу вел Майоров А.А.
Коллекция музея формировалась из разных источников. Помощь оказали Институт биологии южных морей (г. Севастополь), Ленинградский университет, Зоологический институт АН, Областной краеведческий музей. Но самый существенный вклад внес Зоологический музей МГУ, который передал нашему музею большое количество экспонатов и оборудования.
Часть коллекции музея формировалась за счет дарений и приобретения экспонатов у частных лиц. Сотрудники кафедры, студенты пополняли коллекцию, возвращаясь из экспедиций и практик.
Летом 1982 г. приказом ректора зоологический музей стал самостоятельным подразделением. Первым заведующим стал Сальников Г.М., который внес неоценимый вклад в развитие музея. В 1995-1998 гг. музеем руководил Егоров С.Н.
В настоящее время музей занимает две аудитории в 4-ом уч. корпусе ИвГУ (пр. Ленина, 136). Часть экспонатов размещена в коридоре. В экспозиции представлено 90 видов млекопитающих, 190 видов птиц, коллекции рептилий, амфибий, рыб, беспозвоночных. Кроме занятий со студентами в музее проводятся экскурсии со школьниками, учителями и т.п.
Общее руководство работой музея осуществляет зав. кафедрой ботаники и зоологии доц. Минеева Л.Ю., научный куратор музея – доц. Тихомиров А.М.
С 1999 г. зав. музеем является Майоров Александр Александрович (конт. тел.: 8920-676-96-74).